Prof. Dr. CandeÄŸer Yılmaz, Türkiye´de ilk kez 2000 yılında 10 hafta süreli ve uygulamalı "Obezite Okulu" uygulaması baÅŸlatmış olup yine Türkiye´de ilk kez 2001 yılında "SaÄŸlık Halk Kongresi" düzenlenmesini saÄŸlamış; 2009 yılındaki sekizinci kongrenin baÅŸkanlığını yapmış ve bu kongrenin kitabının oluÅŸmasında aktif olarak çalışmıştır.
Prof. Dr. Yılmaz; 2000 yılında Roche Tıp Ödülü ikinciliÄŸini, 2002 yılında Antalya´da Endokrinoloji Kongresi´nde En Ä°yi Sözel Sunum Ödülü’nü, Dahili Bilimler En Ä°yi AraÅŸtırma Ödülü’nü ve Servier Proje Ödülü Ä°kinciliÄŸini, 2003 yılında Amerikan Endokrinoloji TopluluÄŸu Genç AraÅŸtırıcı Ödülü’nü, Türk Diyabet Vakfı Proje Ödülü üçüncülüÄŸünü, 2006 yılında Diyabet Vakfı En Ä°yi Bilimsel yayın yarışması ikincilik ödülünü, 2008 yılında ise Türk BaÅŸarı Ödülleri Kurulu Benal Nevzat Arıman BaÅŸarı ve Onur Ödülü ile Ankara Tabip Odası Dr. Füsun Sayek Bilim ve Hizmet Ödülü´nü kazanmıştır.

Ä°zmir Tabip Odası, Türkiye Endokrinoloji ve Metabolizma DerneÄŸi, Üreme Hastalıkları DerneÄŸi, Türkiye Diyabet Beslenme DerneÄŸi, Hipertansiyon DerneÄŸi, Ege Obez Hastalıkları DerneÄŸi, Ege Osteoporozlu Hasta DerneÄŸi, Ege Diyabetli YaÅŸamı KolaylaÅŸtırma DerneÄŸi, Türkiye Obezite AraÅŸtırma DerneÄŸi üyesi olan Prof. Dr. Yılmaz; 24 Kasım 2009 tarihine kadar 39 kitap ve 59 tanesi SCI kapsamındaki dergilerde olmak üzere toplam 183 bilimsel makale yayımlamış, çeÅŸitli bilimsel toplantılarda 110 tebliÄŸ sunmuÅŸtur.

6 AÄŸustos 2008 – 12 AÄŸustos 2016 tarihinleri arasında Ege Üniversitesi’nin ilk bayan Rektörü olarak 2 dönem görev yapan Prof. Dr. CandeÄŸer Yılmaz, 15 AÄŸustos 2016 tarihinde emekli olmuÅŸtur.